As notas de aquisição de serviço devem ser lançadas pelo menu:

Compras - Estoques -> Compras -> Recebimento de Nota

Click em incluir(+), dever preencher os campos da serie, NFe (Numero da nota de serviço), Frete Sem frete, Modelo  98.  E os demais necessários para sua organização.

Figura 1-Imagem da tela"Cadastro de recebimento de nota", destacando os campos "Serie" e "Modelo"

É preciso ter um item cadastrada genericamente para os lançamentos de serviço, o nome fica a critério de cada empresa, mas o grupo de inventário deve ser 9-Serviço e o NCM pode ser o 00000000, caso o NCM não esteja cadastrado basta incluir um novo. 

Figura 2-Imagem da tela "Cadastro de item", destacando o campo "Grupo de inventário"

Incluindo o item na nota, click em incluir(+), selecione o item, o grupo de imposto de aquisição de serviço(Na duvida da tributação verificar como cadastrar o grupo de imposto antes de incluir o item)
campo quantidade 1 e o valor do serviço tomado. 

Figura 3-Imagem da tela "Itens de movimento", destacando os campos "Puxa dados do produto" e "Grupo de imposto"

Na duvida sobre quais impostos lançar, se tem retenção ou redução e quais CST utilizar, VERIFICAR ANTES COM SUA CONTABILIDADE!!!

Figura 4-Imagem do cadastro de imposto", destacando os campos "Grupo", "Impostos do grupo" e "CFOP"

Link do manual de Grupo de imposto

https://methos.tomticket.com/kb/manuais-de-treinamento-methos-cloud/cadastro-de-grupo-de-imposto